原位启动标记法（Primed in situ labelling,PRINS），又叫寡核苷酸启动法（Oligonucleotide－priming method）是Koch（1987）首先提出的，其基本原理是将未标记的寡核苷酸探针与细胞或组织中的靶DNA或RNA进行杂交，然后该寡核苷酸探针充当引物的作用，在Kelow多聚合酶的催化作用下，将生物素（或地高辛、荧光素）标记的核苷酸编入，以达到原位显示的目的。PRINS技术具有3个方面的优点：首先由于探针在杂交时是未标记的，仅在杂交之后才进行标记，因此背景染色很低。至少，从理论上讲，背景染色几乎是零。其次是有效地缩短了实验的时间，由于探针未经标记，无增加背景染色的顾虑。因此，可增加探针尝试，缩短反应时间。杂交反应时间只需1h。实验反应时间的缩短可有效的保持细胞或组织结构的完整性。第三个优点是能提高或增加信号的强度。Koch等曾成功的将此方法应用于染色体制片、单层细胞涂片和组织切片。它们还将此法与流式细胞计相结合以达到检测群体离散细胞的目的。

在染色体或单层细胞涂片，载片在70℃的溶液中变性（70%甲酰胺，2×SSC）2min，立即在系统酒精中脱水（70%，80%，90%，95%,100%，V/V），用吹风机吹干。预孵育在37℃～53℃20～30min，孵育时间加盖玻片，孵育液含2～4pmol寡核苷酸探针，dATP，dCTP，dGTP各10mmol,5mmol生物素-11-dUTP在25μl×NT缓冲液中（1×NT缓冲液含50mmol/l Tris –HCl,pH7.2,10mmol/L MgSO₄,100μM二硫苏糖醇（dithio threitol）,50μg/ml牛血清白蛋白），在预孵育时加入1μl的Klenow多聚酶。应用100ml 50mmol/L EDTA, 50mmol/L NaCl在65℃洗1min 以终止反应，然后放入100ml×BN缓冲液（100mmol/l NaHCO₃,Ph8.0,0.01%Nanidet P-40）40℃，进行检测系统的显示如荧光-亲合素标记，过氧化物酶-亲合素标记等。

总之，自Gall 和Pardue 1969年建立杂交免疫细胞化学以来的20余年中，已有不少新的改良的方法出现，但基本原则仍为Gall和Pardue所建立的相仿。作者个人体会是任何方法需在本人的实验实践中加以体验和改良。比如目前对乙酰基化作用，即浸入醋酸酐和三乙醇胺是否能减低背景染色的问题有作者对此提出异议。在科技工作者认为在原位杂交实验的所有应用溶液中加入0.1%～0.2%的二乙基焦碳酸乙酯（diethyl pyrocarbonate, DEPC）能有效的减低背景染色，但有些作者对此持怀疑态度。蛋白酶K的消化作用曾被认为是增加细胞或组织渗透性的关键步骤，但有作用在自身的实验室实践中体会除结构较致密的组织如脑、脊髓等外，对培养或涂片的单层细胞、蛋白酶K的消化及预杂交均是可以省略的。本文列举各作者的操作步骤略有不同，可能是基于这个原因。

目前，原位杂交技术主要应用于基因组图（Gene mapping），基因表达定位（localization of gene expression），核DNA和RNA的排列，mRNA的排列和运输（arrangement and transport of mRNA），复制（replication）和细胞的分类（sorting of cells）。临床研究应用在细胞遗传学（Cytogenetics），生前诊断（Prenatal diagnosis），肿瘤和传染性疾病的诊断，生物学剂量测定（biological dosimetry）和病毒学的病原学诊断等。随着核酸探针的制备，标记方法和基本操作方法的不断改进，新的技术不断涌现，相信在不久的将来，原位杂交化学技术将会更广泛的被应用于各个学科，并不断为生命科学提供新的资料，开拓新的领域。