卷一
《伤寒论》论伤寒，《金匮要略》论杂病，乃仲景全书。《伤寒论》得成无己创注，续者五十余家，故得昌明宇内∶《金匮要略》人罕言之，虽有赵良、徐彬等注释，但其文义古奥，系千载残编错简，颇多疑义，阙文亦复不少，承讹袭谬，随文蔓衍，宜后人视为迂远，束诸高阁。今于其失次者序之，残缺者补之，博采群书，详加注释，俾二书并行于世，庶后之业医者，不为俗说所误，知仲景能治伤寒，未尝不能治杂证也。
- 卷一《订正仲景全书金匮要略注》
- 卷一《王氏医案绎注》
- 卷一《归砚录》
- 卷一《对山医话》
- 卷一《存存斋医话稿》
- 卷一《丛桂草堂医案》
- 卷一《三家医案合刻》
- 卷心竹叶《药性切用》
- 卷一《伤寒心法要诀》
- 卷下一《本草问答》
- 卷之二《广瘟疫论》
- 卷下五《本草问答》
- 卷之二 《目经大成》
- 卷下四《本草问答》
- 卷之六《千金宝要》
- 卷下三《本草问答》
- 卷之三《妇人大全良方》
- 卷下二《本草问答》
- 卷之三 《目经大成》
- 卷下《黄帝明堂灸经》
- 卷之上《针灸问对》
- 卷下《张畹香医案》
- 卷之五《证治准绳·疡医》
- 卷下《医暇卮言》
- 卷之五《针灸大全》
- 卷下《徐批叶天士晚年方案真本》
- 卷之下《针灸问对》
- 卷下《重庆堂随笔》
- 卷之一《万病回春》
- 卷下《疡科心得集》
- 卷之中《针灸问对》
